O Hospital Metropolitano Dom José Maria Pires desenvolveu uma série de protocolos e instruções de trabalho, objetivando a padronização do serviço. Os protocolos orientam os métodos de atuação, para que cada profissional atue conforme as recomendações, a fim de propiciar segurança na assistência ao paciente.
O Protocolo (PT) descreve uma situação específica de assistência/cuidado, com detalhes operacionais e especificações sobre o que fazer, quem fazer e como fazer.
A Instrução de Trabalho (IT) é uma descrição detalhada de atividades específicas, produtivas e operacionais. É usualmente utilizada para descrição de atividades técnicas, tendo por característica, portanto, ser um padrão técnico.
Documentos Institucionais COVID
Algoritmos Terapêuticos: Protocolo de Condutas do Paciente com COVID-19 
Assistência Odontológica Ao Paciente Com COVID-19 – HM
Assistência Terapêutica Ocupacional a Pacientes com COVID-19 – HM
Avaliação Fonoaudiológica Para Paciente COVID-19 – HM
Critérios Para Admissão e Permanência de Pacientes com COVID-19 – HM
Coleta E Transporte De Secreção Respiratória De Paciente Suspeito De Covid-19 – HM
Contingenciamento de Insumos – HM
Distribuição de Roupa Privativa a Profissionais na Assistência Aos Pacientes Suspeitos ou Confirmados por COVID-19
EPIs Para Transporte De Pacientes Com Covid-19 – HM
Intubação Orotraqueal COVID-19 – HM
Limpeza De Produtos Para Saúde Utilizados No Atendimento a Pacientes Com Suspeita Ou Casos Confirmados Covid-19 – HM
Limpeza E Desinfecção Das Viseiras E Óculos – HM
Limpeza E Desinfecção De Superfícies E Equipamentos Em áreas Com Pacientes Suspeitos De Covid-19 – HM
Mobilização e Exercícios Terapêuticos Para Pacientes em Ventilação Mecânica – HM
Orientação Sobre A Desmontagem E Limpeza De Sala Cirúrgica Para Procedimento Em Pacientes – HM
Orientação Sobre A Utilização De Epis No Atendimento Aos Pacientes Suspeito Ou Confirmados De Covid-19 – HM
Orientações Para Óbito Por Covid-19 – HM
Oxigenoterapia Hospitalar na COVID-19 – HM
Processamento de Roupas – HM
Protocolo De Drogas Para Sedoanalgesia e Vasoativa – HM
Protocolo De Posição Prona – HM
Protocolo De Sistema Fechado De Aspiração – HM
Raio-X em Pacientes Internos Suspeitos ou Confirmados com COVID-19
Terapia Nutricional Para Paciente Com COVID – 19 – HM
Testagem Para COVID-19 Em Pacientes Pré Operatórios – HM
Testagem Para COVID-19 Em Pacientes Pré Operatórios de Cirurgias de Grande Porte – HM
Testagem Para COVID-19 Da Unidade de Transplante Cardíaco do HMDJMP
Tomografia Computadorizada em Pacientes Externos Suspeitos ou Confirmados com COVID-19
Triagem de Sintomáticos e Assintomáticos Respiratórios no Ambulatório – HM
Utilização De Equipamentos De Proteção Individual (Epis) Para Covid-19 – HM
Ventilação Mecânica Invasiva No Paciente Com Insuficiência Respiratória – HM